بخش مرکزی شهرستان خلخال به مرکزیت شهر خلخال شامل : 
        دهستان خانندبیل شرقی 

        دهستان خانندبیل غربی

         دهستان سنجبد شرقی

بخش خورش رستم شهرستان خلخال به مرکزیت شهر هشجین شامل : 

        دهستان خورش رستم جنوبی

        دهستان خورش رستم شمالی

بخش شاهرود شهرستان خلخال به مرکزیت شهر کلور شامل :

        دهستان پلنگا

        دهستان شال

        دهستان شاهرود

زبان مردم بخش مرکزی و عمده روستاهای این شهرستان ترکی آذربایجانی می‌باشد. در برخی از روستاها و بخش‌ها گویشهای تالشی، تاتی و کردی نیز رواج دارد.